Как указано в этом вопросе, это зависит от того, как вы выполняете свой сценарий и какова ваша цель.
Самый простой способ - запустить скрипт так, как . run_1.in
вам будет интересно использовать один из других вариантов, представленных в качестве ответов на этот вопрос. Они также содержат довольно мало информации.
Причина, по которой вы не меняете каталог, заключается в том, что скрипт выполняется в собственной среде. Один из них заключается в том, чтобы выполнить его в собственной среде с использованием вышеуказанного метода, другой - сделать его функцией оболочки. Последнее также подробно описано в ответах на вопрос: « Измените текущий каталог из скрипта».