Существует длинное объяснение сложного сопоставления разрешений Posix с использованием Windows ACE
https://cygwin.com/cygwin-ug-net/ntsec.html
Почти в конце File permissions
К сожалению, вкладка безопасности в диалоговом окне свойств файла в проводнике Windows настаивает на том, чтобы переставить порядок ACE в канонический порядок, прежде чем вы сможете их прочитать. Слава Богу, порядок сортировки остается неизменным, если нажать кнопку «Отмена». Но даже не думай о нажатии ОК ...
Таким образом, поведение не является ошибкой, оно разработано и Windows Explorer
имеет собственное представление, которое не соответствует остальной системе Windows.