Для меню «Пуск» оно находится под Visual Studio 2015 - > Visual Studio Tools -> Windows Desktop Command Prompts -> VS2015 x64 Native Tools Command Prompt
.
Тем не менее, фактический ярлык %comspec% /k ""C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 14.0\VC\vcvarsall.bat"" amd64
(по крайней мере, в моей настройке).