Вы сравниваете файлы в двоичном режиме, когда файлы не являются текстовыми файлами с хорошо известными разделителями конца строки или разделителями строки. Примером могут быть некоторые двоичные файлы данных. В этом случае вы можете захотеть увидеть смещение и шестнадцатеричные значения различий, а не отображать некоторые версии текста до и после.
Смотрите этот вопрос и этот список