Насколько я помню, вы должны указать категорию node.js.
Я давно не пользовался FreeBSD, но думаю, что он находится под «www» или «lang». Вы должны сделать:
pkg install www/node
или же
pkg install lang/node
Если вы хотите, вы можете добавить в закладки эту страницу FreeBSD .