На самом деле я не использую Zend Studio, однако он основан на платформе Eclipse. Для установки по умолчанию Eclipse Ctrl+ /обычно отображается для переключения комментариев. Я также видел Ctrl+ /сопоставленный с комментарием и Ctrl+ \используемый, чтобы раскомментировать.
Вы всегда можете проверить привязку клавиш, перейдя в Window-> Preferences и выбрав «Keys» в разделе «General» настроек.