Есть несколько вирусов, которые могут заразить MBR или BIOS, например:
http://www.webroot.com/blog/2011/09/13/mebromi-the-first-bios-rootkit-in-the-wild/ https://blogs.mcafee.com/mcafee-labs/bioskits- Join-ранги-оф-стелс-вредоносных программ
Обратите внимание, что вирус MBR может повлиять на вас, даже если вы используете Live CD, если вы загружаетесь с GRUB и вручную выбираете перенаправление процесса загрузки на Live CD.
Однако большинство таких вирусов работают только на платформах Windows, и вы не можете подхватить такой вирус с помощью Ubuntu. Итак, настоящий вопрос: чисты ли ваши MBR и BIOS?