Ошибка установки Pysam в Cygwin

329
Kristen

Я новичок в Cygwin и Python. Я пытаюсь установить Pysam, но в конце получаю следующие ошибки:

Traceback (последний вызов был последним): Файл "", строка 1, в файле "/tmp/pip-install-imo2XD/pysam/setup.py", строка 223, в файле htslib_make_options = run_make_print_config () File "/ tmp / pip- install-imo2XD / pysam / setup.py ", строка 69, в run_make_print_config stdout = subprocess.check_output ([" make "," -s "," print-config "]) файл" /usr/lib/python2.7/ subprocess.py ", строка 212, в процессе check_output = Popen (stdout = PIPE, * popenargs, ** kwargs) Файл" /usr/lib/python2.7/subprocess.py ", строка 390, в init errread, errwrite) Файл "/usr/lib/python2.7/subprocess.py", строка 1025, в _execute_child повышения child_exception OSError: [Errno 2] Нет такого файла или каталога

----------------------------------------

Сбой команды "python setup.py egg_info" с кодом ошибки 1 в / tmp / pip-install-imo2XD / pysam /

Если я попробую только $ python setup.py egg_info

python: невозможно открыть файл 'setup.py': [Errno 2] Нет такого файла или каталога

Что / как мне установить?

Любая помощь приветствуется!

0
pysam, вероятно, требует samtools http://samtools.sourceforge.net/ в качестве интерфейса, который недоступен в cygwin matzeri 5 лет назад 0

0 ответов на вопрос

Похожие вопросы