Потеря фокуса в Firefox обычно вызвана одним (или несколькими) дополнением (ями).
Это легко проверить, запустив Firefox в безопасном режиме . Если проблема затем исчезает, то можно выборочно отключать надстройки, пока не будут найдены виновные надстройки.
Поступали сообщения о надстройке Flash, и, как выяснил автор, комбинация надстроек ThumbnailZoomPlus и Gnome3 также может вызывать эту проблему.