Образ диска будет содержать только те данные, которые идут на диск. Как таковой он будет содержать только файловую систему и данные файла, которые находятся на уровне выше формата физического диска.
Физическая структура предназначена для физических объектов и не обязательно применима к данным изображения.
Например, физический жесткий диск содержит много данных для проверки физических ошибок. Эти данные относятся к самому накопителю и не читаются (и не имеют значения) при создании образа с помощью dd.
То же самое относится и к образам дискет.