Ну, на самом деле я спросил об этом на сайте бета-версии Sound Design, и получил хороший автономный ответ:
https://sound.stackexchange.com/questions/28189/downmixing-audio-on-command-line
чтобы указать 16-битное или 24-битное wav-файл с прямым порядком байтов (intel):
afconvert -d LEI16 -c 1 --mix input_file.wav output_file.wav
или же
afconvert -d LEI24 -c 1 --mix input_file.wav output_file.wav