start
имеет странный синтаксис, где первая строка в кавычках является новым (консольным) заголовком окна. Ваша команда start
заключена в кавычки, поэтому интерпретирует ее как заголовок и не знает, что это /s
такое.
Итак, добавьте фиктивный заголовок, например так:
START /WAIT "" "%userprofile%\desktop\jre-8u25-windows-i586.exe" /s