Ubuntu и Windows почти наверняка установлены на разных разделах. В Ubuntu вы можете отформатировать раздел, на котором установлена Windows, а затем обновить свое меню GRUB, чтобы удалить его.
Я бы порекомендовал использовать gparted для разметки в Linux. Если он еще не установлен, вы сможете найти его в менеджере пакетов. Вы можете отформатировать раздел и оставить его в покое, или вы можете расширить свой раздел Ubuntu, чтобы занять это новое свободное место. Имейте в виду, что расширение раздела может быть очень долгим, иногда медленным процессом.
Чтобы обновить меню GRUB, запустите gksu gedit /boot/grub/menu.lstи удалите запись для Windows Server из списка. Это должно быть довольно просто, но если вы не понимаете, что удалить из файла, прокомментируйте здесь, и мы поможем вам разобраться.