Я видел некоторых пользователей, которые говорили, что их антивирусная программа обнаружила троян в WinMD5Free.exe, поэтому я бы не стал доверять этому.
Однако я рекомендую другую программу, которая мне показалась полезной; HashCheck. Это с открытым исходным кодом, так что любой может проверить это и скомпилировать программу для себя. Ссылка на домашнюю страницу находится здесь: http://code.kliu.org/hashcheck/