Джира поддерживает Bitbucket . Это тип контроля версий, похожий на Tortoise SVN (на мой взгляд, он лучше).
Я лично использовал функцию Bitbucket еще тогда, когда она была известна как Stash. Он очень хорошо работает для управления исходным кодом для кода, и я уверен, что он хорошо послужит вашей цели, будучи использованным в качестве общего файлового ресурса (мы даже рассматривали возможность его использования на моей прежней работе). Фактически, он должен отслеживать изменения в файлах при правильной настройке - код или нет.
Есть также много других дополнений для Jira, которые, похоже, будут вам полезны, в том числе ...