Я не думаю, что VFAT поддерживает тип разрешений, которые вы пытаетесь установить. В таком случае разрешения устанавливаются одинаковыми для всех файлов при монтировании диска. Что-то вроде:
sudo mount -t vfat -o uid=piftp,gid=piftp /dev/sda1 /var/www
См. Также Невозможно изменить разрешение / владельца / группу внешнего жесткого диска в Ubuntu здесь, на Super User, или внешний ресурс. Подключите Raspberry Pi к жесткому диску USB .