цикл в команде awk

Question

0

У меня есть файл со следующими входными данными:

Sample1  Feature 1 A B C D Feature 2 E F G  Sample2:  Feature 1 H I Feature 2 L O P

И я хотел бы получить следующий вывод:

Sample1 Feature 1: 4 Feature 2: 3 Sample2 Feature 1: 2 Feature 2: 3

В общем, я пытаюсь подсчитать, сколько элементов в каждой функции, и для каждого образца в отдельности

Я попытался с помощью следующей команды:

awk ' else } END }' inputfile> выходной файл

Но это в основном дало мне следующий вывод (он подсчитал все функции для всех образцов)

Feature 1: 6 Feature 2: 6

Может кто-нибудь помочь мне изменить эту команду или предложить другую?

bash awk

410 просмотров

Monah спросил 8 лет назад

M 1

Answer 1

файл summarize.awk:

function print_feature() { if (feature) print feature ": " n n = 0 feature = "" } NF == 0 { # empty line.  print_feature() # print the feature summary in_feature = 0 # we are no longer counting elements next # do not print the empty line } $1 == "Feature" { # a new feature print_feature() # print the previous feature summary feature = $0 # save this as the new feature in_feature = 1 # indicate we are counting elements next # do not print ... yet } { if (in_feature)  n++ # count this element else # or print # print (e.g. "Sample") } END { print_feature() # if there is no trailing blank line, print the current feature }

затем

$ awk -f summarize.awk file Sample1 Feature 1: 4 Feature 2: 3 Sample2: Feature 1: 2 Feature 2: 3

цикл в команде awk

1 ответ