Я не знаю ни о каком конкретном приложении, которое сделает это для вас, но вы можете использовать Yahoo Pipes, чтобы сделать это для вас. Вы можете создать свой собственный канал, который отфильтровывает дублирующиеся элементы в определенном канале RSS, а затем направить предпочитаемый читатель RSS на вновь созданный канал от Yahoo.
Я уже давно использую эту технику, чтобы вы объединили все отдельные новостные ленты BBC. Вы можете просмотреть и клонировать трубу, которую я создал здесь . Или гораздо более простой, который просто делает дедупликацию здесь .