Я не проверял libgit2, но ни git, ни различные $PATHпользователи - такие как execvpe()функция Glibc и различные оболочки ( dash, bash ) - не поддерживают какую-либо форму экранирования - если имя каталога содержит a :, его просто нельзя использовать как часть пути переменные среды.
В Windows разделитель пути ;- вы должны иметь возможность использовать PATH_SEPили подобную константу для поиска значения - и опять же, экранирование нигде не поддерживается.
Если пользователь дает вам такой путь /usr/foo:bar, то он может ожидать, что он будет разделен на две директории, поэтому просто сделайте это.