Твисти и Даниэль Б. оба дали хорошие ответы; тем не менее, существует серьезное предостережение: поддержка GPT зависит от используемой ОС. В этом вопросе в качестве ОС указывается «Windows Server», а не используемая версия Windows Server. Безусловно, все последние версии Windows поддерживают GPT для дисков с данными; однако, более старые версии не делают. Страница Wikipedia на GPT содержит подробную информацию о различных версиях Windows. Исходя из этих таблиц, только 32-разрядные версии Windows Server 2003 и Windows XP не имеют такой поддержки; однако, я полагаю, что в этих таблицах могут быть некоторые тонкости. (IIRC, Windows Vista, например, приобрела поддержку GPT с пакетом обновления 1 (SP1). Я, возможно, неправильно запомнил это, так что воспринимайте это с недоверием.)
Есть еще одна оговорка: драйверы дисков иногда накладывают свои собственные 32-разрядные ограничения, что может приводить к тому, что диски размером более 2 ТБ выглядят так, как будто они имеют размер менее 2 ТБ. (Как правило, вы получаете диск, который выглядит по модулю 2 ТБ, поэтому диск размером 3 ТБ, например, будет иметь размер менее 1 ТБ.) Подобные проблемы были довольно распространенными, но я видел меньше сообщений о их недавно. Предположительно, ошибки были в основном исправлены; тем не менее, вы все равно можете столкнуться с проблемой, особенно если вы используете более старый стек драйверов. Я рекомендую проверить видимый размер диска, прежде чем начать его использовать. Если размер выглядит неправильно, обновите драйверы.
В общем, тогда вы, вероятно, в порядке. Если вы используете Windows Server 2003, вы должны были выполнить обновление давно по причинам, отличным от поддержки GPT. Если нет, у вас больше нет повода откладывать это.