Ну, Ворбис это не видео. Это аудиокодек, обычно встроенный в формат контейнера Ogg. Может быть, отсюда и путаница.
Вы хотите использовать Theora с libtheora. Кроме того, вы должны указать видео и аудио кодеки вместо того, чтобы ffmpeg выбрал один. Обычно я добавляю -shortestкоманду ffmpeg прекратить кодирование, когда больше нет изображений или звуковая дорожка закончена.
ffmpeg -f image2 -r 1 -i "dir\%04d.png" -i "dir\audio.wav" -c:v libtheora -c:a libvorbis -shortest -r 25 out.ogv Проверьте руководство по кодированию Theora / Vorbis для качественных вариантов.