Ничего не изменилось со времен Mini PCIe. Карты WiFi с Bluetooth по-прежнему имеют интерфейс Bluetooth с хост-системой через USB. Например, посмотрите спецификации пакета Intel Dual Band Wireless-AC 8265 . Он определяет как PCIe, так и USB.
Кроме того, некоторые карты WWAN могут использовать его.
/ edit: Да, вот один: Huawei MU736 . Он использует USB 2.0 для связи с хост-системой. Он использует некоторые дополнительные контакты для общения с SIM-картой. SIM-карта вставляется в доступное для пользователя место, которое может находиться на некотором расстоянии от карты WWAN.