Обычно локальные данные Launchy хранятся в %AppData%/Launchy(вы можете ввести именно эту строку в адресную строку Windows Explorer). launchy.iniэто файл, содержащий все ваши настройки, такие как индексированные папки и предпочтительные совпадения для любых неоднозначных строк (например, если вы вынуждены boxиспользовать для VirtualBox вместо Dropbox).
Две папки кэша значков и launchy.db/ history.db, вероятно, лучше оставить там, где они есть, так как Launchy будет восстанавливать их в любом случае при следующем запуске.