Это связано с тем, что launchy является приложением x86. Из-за этого, когда он пытается выполнить программу из папки «Program Files», путь преобразуется в «Program Files (x86)», а затем происходит сбой, потому что программы там нет.
См. Этот пост для получения дополнительной информации: http://sourceforge.net/projects/launchy/forums/forum/766268/topic/3356037
Помимо использования бета-версии x64, вы можете использовать обходной путь: создайте сценарий wsh, который запускает вашу программу, и создайте ссылку на этот файл.