Вы сталкиваетесь с ошибками при удалении фреймворка?
Вы можете попробовать это чистое удаление от парня, который работает в MS, а затем переустановить здесь @ http://www.microsoft.com/net/download.aspx, хотя вы уже говорили, что уже запустили инструмент для очистки.
http://blogs.msdn.com/b/astebner/archive/2008/08/28/8904493.aspx