Решение на самом деле не в том, чтобы использовать последний пакет обновления, так как он восстанавливает конфигурацию, которая используется в данный момент во время установки.
Итак, мой предварительный шаг:
d-i preseed/late_command string \ in-target sed -i 's#^\(GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="quiet\)"$#\1 root=/dev/sda1"#' /etc/default/grub \ in-target grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg ; \ in-target sed -i 's/root\=\/dev\/sdb1/root\=\/dev\/sda1/g' /boot/grub/grub.cfg ;