В двух перечисленных ниже опциях TortiseHg откроет все репозитории, которые вы открыли, когда закрывали его, и откроет их для ревизии рабочего каталога.
Включите опцию «Сохранить открытые репозитории при выходе» в меню просмотра.
В диалоговом окне «Настройки TortoiseHg» под WorkBench есть настройка «Начальная редакция», выберите рабочий каталог.