Вы можете просто создать мятный ярлык с этими настройками:
Target: C:\cygwin\bin\mintty /bin/env CHERE_INVOKING=1 /bin/bash -l Start in: C:\Users\yourName
Сценарии не требуются. Установка CHERE_INVOKING останавливает / etc / profile изменять каталог на $ HOME. (Эта переменная происходит из пакета 'chere'.)