Программа ClearMRU в Windows Media 7 Power Toys имеет параметр командной строки для запуска без каких-либо подсказок.
clearmru.exe /q
В вашем случае добавьте / q в конец командной строки.
Вы также можете создать ярлык для программы в меню «Пуск» с помощью той же командной строки, чтобы запустить ее без запуска командной строки.