Я наконец-то понял, как это сделать. Я должен был перейти к Render> More Options> Render с использованием прокси-клипов (также я должен использовать FFV без потерь, он же * .mkv)
Не уверен, почему это потребовало, чтобы я использовал прокси-клипы, но это сделало. Вероятно, потому что клипы были сырыми из приложения для Android / iphone под названием Marco Polo, которое могло иметь некоторую странную кодировку.