В Apache вы можете определять шаблоны (аналогично mod_cgi), которые обозначают запросы, отправляемые в приложения FastCGI. Mod_fcgid - это менеджер процессов FastCGI, порождающий каждое уникальное приложение с определенными разрешениями (suexec).
Это не возможно с Lighttpd. Lighttpd не имеет встроенного диспетчера процессов FastCGI, который может изменять разрешения (что делает mod_fcgid).
Наиболее близким к lighttpd является spawn-fcgi, который по совпадению происходит из проекта lighttpd. Взгляните на вики Lighttpd ModFastCGI в разделе Внешний спавнинг .