Вы можете создать скрипт .bat, содержащий команду (shutdown -r -t 0), сохранить его как reboot.bat, а затем поместить его в подходящее место в вашей системе. Если местоположение еще не в PATH, добавьте его в PATH, используя команду ниже. Это будет работать при использовании его в CMD. Для использования с RUN, см. Комментарий grawity ниже.
set PATH = %PATH%;C:/Directory/Where/You/Saved