Я попробовал 32-битную и 64-битную версии MySQL Workbench 6.3 (все мои машины 64-битные). Тот же результат. Я попробовал 64-битную версию Workbench 6.2. То же самое. Самая новая версия, с которой она работает, - это 32-разрядная версия Workbench 6.1 (единственная версия, доступная для загрузки по адресу https://dev.mysql.com/downloads/workbench/6.1.html ).
Тем не менее, я думаю, что Percona официально не поддерживает MySQL Workbench.