Если вы хотите отключить автоматическую маркировку и нумерацию навсегда, нажмите Инструменты -> Параметры -> Редактирование и снимите флажок из Применить нумерацию / маркировку к спискам автоматически.
Это прямая вставка с http://blogs.msdn.com/b/onenotetips/archive/2008/06/11/outlining-in-onenote.aspx