Поскольку я не знаю о концепции защелкивающихся окон в Vim, я предполагаю, что вы имеете в виду расположение других окон приложений рядом с (G) VIM. Я подозреваю, что это происходит, когда размер самого Vim изменяется.
Поскольку вы намекаете на возможное соединение с разделением окон Vim, оно может быть вызвано вертикальным разделением, которое в конфигурации по умолчанию вызывает появление дополнительной полосы прокрутки (слева), что увеличивает ширину окна приложения Vim. Вы можете избежать этого через
:set guioptions-=L