Файлы, вероятно, оказались в %LOCALAPPDATA%\VirtualStore
. У меня была похожая проблема с некоторыми программами, которые сохранялись в защищенной папке (Program Files) без должного повышения прав (UAC) в Windows Vista.
Смотрите здесь для более подробной информации.
Согласно этому сайту, Compatibility files
в Windows Explorer должна быть опция. Лично я никогда не замечал этого раньше, но он появляется и работает.
(Изображение взято из связанного сайта)