В вашем тестовом коде я не вижу "%% a" (имя файла для использования) в вызове MediaInfo, а также не вижу экранированного "%" ("%%") в параметрах MediaInfo (без экранирования в процентах), MediaInfo получает пустые строки из-за "%", преобразованного пакетным процессором).
Я успешно сделал то, что вы пытаетесь сделать с:
>dir test 06/09/2017 14:02 2 869 248 MOV001 - Copy.MOD 06/09/2017 14:02 2 869 248 MOV001.MOD >more a.bat @echo off for %%f in (%*) do ( MediaInfo.exe "--Output=General;%%FileName%%, %%Format%%" "%%f" ) >MediaInfo.exe "--Output=General;%FileName%, %Format%\r\n" test\* MOV001 - Copy, MPEG-PS MOV001, MPEG-PS a.bat test\*.* MOV001 - Copy, MPEG-PS MOV001, MPEG-PS