Применить поле деформации, не влияя на интенсивность

350
user10859

Я работаю с Объемами (трехмерными матрицами), и я получил геометрические поля преобразования и смещения от функции imregtform . Мое движущееся изображение и фиксированное изображение являются двоичными изображениями (0 и 1). Теперь я хочу применить то же геометрическое преобразование (или поле смещения) к другой версии (это не бинарное изображение) движущегося изображения. Я не хочу использовать imwarp, поскольку он меняет значения в изображении. Итак, я хотел бы применить преобразование, не затрагивая значения в изображении.

Я написал следующую функцию MATLAB, чтобы сделать то же самое, используя поле Displacement:

 function [ Volumeafterd ] = ApplyDeformation2Volume( Volume, Deformation, OPFilename) % Detailed explanation goes here  %% Check the Size SizeD = size(Deformation); SizeV = size(Volume); Volumeafterd = zeros(SizeV(1),SizeV(2),SizeV(3)); if SizeV(1) == SizeD(1) & SizeV(2) == SizeD(2) & SizeV(3) == SizeD(3) %% Apply the Deformation fnd = find(Volume~=0); counterd1=0; for it=1:length(fnd) [x,y,z] = ind2sub(SizeV,fnd(it)); d1 = squeeze(Deformation(x,y,z,:)); x1=round(x+d1(1));y1=round(y+d1(2));z1=round(z+d1(1)); if x1<1 | y1<1|z1<1 fprintf('Non positive index (D1) for x %d, y %d, z %d adding %d,%d,%d to get x %d,y %d,z %d\n'... ,x,y,z,d1(1),d1(2),d1(3),x1,y1,z1); end if (x1>=1 & y1>=1 & z1>=1) if (Volumeafterd(x1,y1,z1)~=0) %fprintf('Over writing %d %d %d\n',x1,y1,z1); counterd1 = counterd1+1; end Volumeafterd(x1,y1,z1) = Volume(x,y,z); end end fprintf("Overwritten counter : %d\n",counterd1); else fprintf("The size of Deformation field and the volume does not match\nThe output will be empty Volume \n"); end end 

Я также пытался использовать tform . Ниже приведен код для этого.

function [ Volumeafterd ] = Applytform2Volume( Volume, TForm, OPFilename)  szV = size(Volume); Volumeafterd = zeros(szV(1),szV(2),szV(3));  counter=0;  %find the non zeros labelled voxels fndnz = find(Volume~=0); for i = 1:length(fndnz) %for i1 = 1:szV(1) % for i2= 1:szV(2) % for i3 = 1:szV(3) [i1,i2,i3] = ind2sub(size(Volume),fndnz(i)); [nx,ny,nz ] = transformPointsForward(TForm,i1,i2,i3); nr = round([nx,ny,nz ]); nx=nr(1); ny=nr(2); nz=nr(3); %if nx<1 | ny<1|nz<1 %fprintf('Non positive index (D1) for x %d, y %d, z %d to get x %d,y %d,z %d\n'... %,i1,i2,i3,nx,ny,nz); %else try Volumeafterd(nx,ny,nz) = Volume(i1,i2,i3); catch % fprintf('Non positive index (D1) for x %d, y %d, z %d to get x %d,y %d,z %d\n'... %,i1,i2,i3,nx,ny,nz); counter = counter+1; end end %end % end % end %end  fprintf('Counter %d for %s \n',counter,OPFilename); end 

Обе функции возвращают один и тот же результат, который ожидается. Но они не копируют то, что делает imwarp . Было бы очень полезно, если бы кто-то мог указать на мою ошибку или направить меня другим путем.

Благодарю.

0

0 ответов на вопрос

Похожие вопросы