Очень неясно, чего вы хотите достичь. Вы должны завершить свой вопрос с четким объяснением того, что вы хотите, с минимальным примером вашего кода (без лишних комментариев и ненужного кода) и с ожидаемым выводом для вводимых вами данных. Если это просто удаление 0x
из файла, этого достаточно:
perl -wple's/0x//g' input.file