Более новая версия Notepad ++ (> 6.1.x, я думаю) теперь поддерживает многострочное сопоставление (сейчас я использую 6.1.5)
В диалоговом окне «Найти / заменить» рядом с переключателем «Регулярное выражение» имеется флажок «. Соответствует новой строке», что означает многострочное сопоставление.
Отметьте этот флажок и используйте это регулярное выражение:
^Where do you want to go next\?.*?^Home$