Разница здесь хорошо объяснена:
libapache2-mod-fastcgi: fastcgi не повторяет select () в EAGAIN
Короче говоря: mod_fcgid передает только один запрос на сервер FCGI за раз, в то время как mod_fastcgiпередает несколько запросов одновременно, последний обычно лучше для PHP, так как PHP может управлять несколькими запросами, используя несколько потоков, и кэши кода операции, такие как APC, обычно работают только с потоками, а не с процессами. Это означает, что при использовании у mod_fcgidвас много PHP-процессов, каждый из которых имеет свой собственный кэш кода операции.
Это также упоминается в документации mod_fcgidпо специальным соображениям PHP .