Новые вопросы с тегом «portable-batch-system»

Я использую PBS для распределения рабочих мест в кластере. Обычно я могу запустить интерактивный режим X11 в узле с помощью: qsub -I -X -l select=1:vnode=gpunode1 но это не работает для нового пользователя. Это просто висит там. Я попытался qstatи увидел, что работа вместо того, чтобы показывать вр...

Я знаю такие команды, как qsub, qstat -a, qstat -an и т. Д. Но как я могу узнать, сколько заданий в очереди у одного пользователя (не обязательно обязательно выполняется) в любой момент времени?

Я хочу отправить отдельные задания в Sun Grid Engine и сделать так, чтобы они выполнялись локально. Вместо создания файлов stdout и stderr для их вывода на вызывающие терминалы stdout и stderr. Согласно этой странице -k oe будут сохранены стандартные выходные данные или стандартные потоки ошибок буд...

Я использую qsub для отправки работ в кластере (SGE). Я хочу знать, когда я отправляю задание qsub и после его завершения я хочу выяснить, сколько памяти он фактически использует, поэтому в следующий раз я предоставлю ему необходимую память на всякий случай. Я использовал эту команду после того, как...

При отправке задания я могу указать qsubпуть для стандартного вывода и стандартную ошибку. С другой стороны, в то время как моя работа 12345 выполняется, я могу получить доступ к дополнительной информации, связанной с ней, используя qstat -j 12345. У меня вопрос, есть ли способ указать путь qsubдля...

Я использую Emacs в системе LINUX, которая использует Portable Batch System (PBS) для управления использованием ресурсов. Сценарии PBS требуют "#PBS -S / bin / ..." в качестве первой строки в сценарии, чтобы объявить оболочку сценария для PBS. Когда я загружаю скрипт в Emacs, нет #! / Bin / ... для...

Я использую PBS qsub для запуска сценария в кластере, который должен вывести файл отчета с именем, в котором указано время отправки пакетного задания. Время отправки пакетного задания - это время, когда оно присоединяется к очереди пакетного задания PBS. Я проверил все переменные по умолчанию в PBS,...

Я пытаюсь выполнить серию заданий, переданных в кластер, одно за другим, используя следующий сценарий .sh: Annotation_Loop.sh: #!/bin/bash job=`qsub run_IntersectBed_1.sh 0` for i in do job_next=`qsub -hold_jid $job run_IntersectBed_1.sh $i` job=$job_next done Первая задача (до входа в цикл) выпо...

Я пытаюсь отправить следующий очень простой скрипт в мой кластер: #!/bin/sh #PBS -l nodes=3:ppn=8,walltime=00:01:00 #PBS -M eamorr@mydomain.com #PBS -j oe #PBS -m bae #PBS -N geophysics pbsdsh date pbsdsh echo $PBS_VNODENUM И вот вывод: Wed Oct 24 12:52:08 IST 2012 Wed Oct 24 12:52:08 IST 2012 We...

У меня гигантские вычисления на кластере Scientific Linux. В настоящее время в очереди припарковано более 600 заданий, ожидающих процессорного времени, в то время как некоторые из них уже запущены. Я пытаюсь использовать Qalter на некоторых но запланированных работах. Я хотел бы запланировать их на...

Я работаю, используя крутящий момент (qsub). Я хотел бы проследить за стандартной ошибкой задания во время его вывода. Обычные выходные файлы (для stdoutи stderr) записываются только после завершения задания. Есть ли способ сделать что-то вроде tail -f /dev/stderr за stderrпредоставленную работу?

Я хочу установить Grid Engine на свой ноутбук. Я использую Ubuntu 11.10 под VirtualBox 4.1.6. (Цель установки Grid Engine - не вычислять что-либо, я просто хочу, чтобы рабочая среда Grid Engine могла опробовать сценарии bash для заданий массива и т. Д. Задания, которые я запускал, просто делали бы "...

ОБНОВЛЕНИЕ: после qsub я много раз замечал, что когда имя хоста - opt ###, оно работает, но для других узлов, в которых имя хоста имеет другую топологию int ###, - нет. Я обсуждал это с менеджером кластера, и вот что он сказал: «Каким-то образом эта библиотека была установлена ​​только на узлах opt...

Поэтому я только что установил Torque на небольшой кластер, который мы настраиваем, и все, казалось, прошло довольно гладко. У меня pbs_monработает на вычислительных узлах и pbs_server работает на головном узле, а pbsnodes -aиз головного узла показывает все узлы в «свободном» состоянии. Тем не менее...

Наш кластер представляет собой кластер Linux с Torque и Maui. Я читаю учебники в Интернете и нахожу, что компиляция происходит только на головном узле, и после отправки задания qsub другие узлы запускают исполняемый файл, скомпилированный на головном узле. Вот почему у меня возникают вопросы. Верн...

Я учусь и у меня есть несколько вопросов об использовании PBS для отправки работ в кластере. (1) Если задание распараллеливается MPI и запускается mpirun без использования qsub, оно может выполняться на разных узлах. Так какой смысл использовать qsub? Задание не отправлено в очередь qsub или нет? (2...