Это зависит от антивируса. Вы можете использовать тест EICAR, который работает с большинством антивирусных программ, чтобы проверить, сколько уровней архивов проверяет ваш.
Большинство, по крайней мере, проверяют архив первого уровня, но это может зависеть от опции антивируса.