Я все время знал, что мои разрешения были правильными в моей установке Python. Чего я не знал, так это того, что если бы папка, находящаяся выше в иерархии, имела более ограничивающие разрешения, это оказало бы влияние.
Решение состояло в том, чтобы вся цепочка каталогов от root до моей установки на python имела разрешения rx.