Я исправил обе проблемы. Сначала я отключил несколько параметров в vsftpd.conf, а затем снова изменил разрешения для каталога.
vsftpd.conf:
#chroot_list_enable=YES # (default follows) #chroot_list_file=/etc/vsftpd/chroot_list
Разрешения были изменены с:
sudo chown -R user:group /var/www sudo setfacl -R -d -m u:user:rwx,g:group:rwx,o::r /var/www