Ваша команда содержит -profile:highфайл, который FFmpeg анализирует как имя опции. Таким образом, -c:aанализируется как его значение. Таким образом, следующий copy, который теперь рассматривается как непарный, обрабатывается как выходное имя. Поскольку он не имеет расширения, FFmpeg не может распознать формат выходного файла.
Правильный синтаксис для профиля -profile:v high
Так что используйте
ffmpeg -i $1 -c:v libx264 -crf 20 -profile:v high -c:a copy -c:s copy -c:t copy $2