eCryptfs сохраняет фактическую парольную фразу монтирования в файле
/home/.ecryptfs/user/.ecryptfs/wrapped-passphrase
Так что уничтожение этого файла будет работать. Тогда даже с паролем пользователя вам придется использовать атаку грубой силы, чтобы восстановить файлы.