Вы не должны запускать git init --bare
себя.
Просто объявите новое имя репо в gitolite.conf
файле gitolite-admin
репо, отправьте его обратно на сервер gitolite, и сам gitolite создаст это репо должным образом (в ~/repositories/mynewrepo.git
виде чистого репо)