В основном это зависит от оконного менеджера. (Хотя он может контролироваться GTK, в конце концов, это зависит от WM.)
Если вы используете Compiz, я думаю, что вы можете указать исключения с помощью CCSM .
У Metacity такой возможности нет. 1
1 В диспетчер окон wmii входит инструмент wihack
, который может переопределить тип окна программы.
Например, wihack -type toolbar vncviewer
. Хотя инструмент является частью wmii, типы окон EWMH используются большинством оконных менеджеров, включая Metacity .