/whoisКоманда на самом деле не связан с каналом - как исходящий запрос и входящий ответ ссылаться только ник целевого человека.
Поэтому разные клиенты принимают разные решения о том, где показывать не связанные с каналом ответы:
Некоторые клиенты, такие как qwebirc (веб-чат freenode), отображают такие ответы в текущем активном окне (буфере). Ответы приходят быстрее, чем вы можете переключать окна после выполнения команды.
Другие клиенты, в том числе Irssi, отображают эти ответы в окне сервера (или в окне состояния). Если вы переключитесь в окно 1, вы найдете там все свои запросы whois.
Если у вас есть запрос окно / (личное сообщение) открыто с этим человеком, Irssi поместит / WHOIS ответ там, потому что он может, по крайней мере ассоциироваться с псевдонимом.